La plupart des communes appartiennent à une ou plusieurs structures intercommunales auxquelles elles ont transféré une ou plusieurs compétences qui nécessitent d'être exercées à un niveau territorial plus large.

Il existe deux grandes catégories d'établissements publics intercommunaux :
       les syndicats de communes
       les établissements publics de coopération intercommunale à ficalité propre

Depuis de nombreuses années, la Commune de Thônes fait partie de plusieurs organismes de coopération intercommunale qui recouvrent tout ou partie du Canton.